النبات
مواضيع عامة في علم النبات
الجذور - السيقان - الأوراق
النباتات الوعائية واللاوعائية
البذور (مغطاة البذور - عاريات البذور)
الطحالب
النباتات الطبية
الحيوان
مواضيع عامة في علم الحيوان
علم التشريح
التنوع الإحيائي
البايلوجيا الخلوية
الأحياء المجهرية
البكتيريا
الفطريات
الطفيليات
الفايروسات
علم الأمراض
الاورام
الامراض الوراثية
الامراض المناعية
الامراض المدارية
اضطرابات الدورة الدموية
مواضيع عامة في علم الامراض
الحشرات
التقانة الإحيائية
مواضيع عامة في التقانة الإحيائية
التقنية الحيوية المكروبية
التقنية الحيوية والميكروبات
الفعاليات الحيوية
وراثة الاحياء المجهرية
تصنيف الاحياء المجهرية
الاحياء المجهرية في الطبيعة
أيض الاجهاد
التقنية الحيوية والبيئة
التقنية الحيوية والطب
التقنية الحيوية والزراعة
التقنية الحيوية والصناعة
التقنية الحيوية والطاقة
البحار والطحالب الصغيرة
عزل البروتين
هندسة الجينات
التقنية الحياتية النانوية
مفاهيم التقنية الحيوية النانوية
التراكيب النانوية والمجاهر المستخدمة في رؤيتها
تصنيع وتخليق المواد النانوية
تطبيقات التقنية النانوية والحيوية النانوية
الرقائق والمتحسسات الحيوية
المصفوفات المجهرية وحاسوب الدنا
اللقاحات
البيئة والتلوث
علم الأجنة
اعضاء التكاثر وتشكل الاعراس
الاخصاب
التشطر
العصيبة وتشكل الجسيدات
تشكل اللواحق الجنينية
تكون المعيدة وظهور الطبقات الجنينية
مقدمة لعلم الاجنة
الأحياء الجزيئي
مواضيع عامة في الاحياء الجزيئي
علم وظائف الأعضاء
الغدد
مواضيع عامة في الغدد
الغدد الصم و هرموناتها
الجسم تحت السريري
الغدة النخامية
الغدة الكظرية
الغدة التناسلية
الغدة الدرقية والجار الدرقية
الغدة البنكرياسية
الغدة الصنوبرية
مواضيع عامة في علم وظائف الاعضاء
الخلية الحيوانية
الجهاز العصبي
أعضاء الحس
الجهاز العضلي
السوائل الجسمية
الجهاز الدوري والليمف
الجهاز التنفسي
الجهاز الهضمي
الجهاز البولي
المضادات الحيوية
مواضيع عامة في المضادات الحيوية
مضادات البكتيريا
مضادات الفطريات
مضادات الطفيليات
مضادات الفايروسات
علم الخلية
الوراثة
الأحياء العامة
المناعة
التحليلات المرضية
الكيمياء الحيوية
مواضيع متنوعة أخرى
الانزيمات
تحديد التوالي بالتشظية Shotgun Sequencing
المؤلف:
د.زهرة محمود الخفاجي
المصدر:
موسوعة الحياة
الجزء والصفحة:
30-1-2020
1669
تحديد التوالي بالتشظية Shotgun Sequencing
تحديد توالي القطع الكبيرة من الجينوم او الجينومات الكاملة الكبيرة والكروموسومات ، وتتم باستعمال طريقة التشظية اذ تجزأ جزيئات DNA الكبيرة ثم يتم تحديد التوالي لكل قطعة لإنتاج المقروءات Reads التي تمتد توالياتها باتجاهين لإعطاء Mate Pairs هي المقروءة Read ، ونهاية المقروءات End Read تجمع في صف طويل من المتجاورات وتستعمل برامج حاسوب ملائمة لتجمعها كما موضح في المثال:
وبالجمع يمكن الحصول على التوالي الأصلي. وقد كانت الطريقة هي المفضلة لعقد من الزمن 1995-2005 ولكن تم تطويرها الى طرق أخرى مثل Next Generation Sequencing وتغطي 25-500 قاعدة وهي سريعة وتعطي تغطية جيدة للتوالي وفي وقت قصير ولكن الدقة ليست بالعالية.
وتعاني طريقة التشظية من قلة الدقة عند وجود المكررات المتشابهة ولكن يعتقد ان تطور برامج الحاسوب يمكن ان تتجاوز هذه المشكلة. وقد طبقت طريقة التشظية عام 1995 لتحديد توالي البكتريا Haemophilus influenzae وأصبحت الطريقة القياسية لتحديد توالي بدائيات النواة وتستعمل بنجاح مع تواليات حقيقيات النواة.
الاكثر قراءة في مواضيع عامة في الاحياء الجزيئي
اخر الاخبار
اخبار العتبة العباسية المقدسة

الآخبار الصحية
