1

المرجع الالكتروني للمعلوماتية

تاريخ الفيزياء

علماء الفيزياء

الفيزياء الكلاسيكية

الميكانيك

الديناميكا الحرارية

الكهربائية والمغناطيسية

الكهربائية

المغناطيسية

الكهرومغناطيسية

علم البصريات

تاريخ علم البصريات

الضوء

مواضيع عامة في علم البصريات

الصوت

الفيزياء الحديثة

النظرية النسبية

النظرية النسبية الخاصة

النظرية النسبية العامة

مواضيع عامة في النظرية النسبية

ميكانيكا الكم

الفيزياء الذرية

الفيزياء الجزيئية

الفيزياء النووية

مواضيع عامة في الفيزياء النووية

النشاط الاشعاعي

فيزياء الحالة الصلبة

الموصلات

أشباه الموصلات

العوازل

مواضيع عامة في الفيزياء الصلبة

فيزياء الجوامد

الليزر

أنواع الليزر

بعض تطبيقات الليزر

مواضيع عامة في الليزر

علم الفلك

تاريخ وعلماء علم الفلك

الثقوب السوداء

المجموعة الشمسية

الشمس

كوكب عطارد

كوكب الزهرة

كوكب الأرض

كوكب المريخ

كوكب المشتري

كوكب زحل

كوكب أورانوس

كوكب نبتون

كوكب بلوتو

القمر

كواكب ومواضيع اخرى

مواضيع عامة في علم الفلك

النجوم

البلازما

الألكترونيات

خواص المادة

الطاقة البديلة

الطاقة الشمسية

مواضيع عامة في الطاقة البديلة

المد والجزر

فيزياء الجسيمات

الفيزياء والعلوم الأخرى

الفيزياء الكيميائية

الفيزياء الرياضية

الفيزياء الحيوية

الفيزياء العامة

مواضيع عامة في الفيزياء

تجارب فيزيائية

مصطلحات وتعاريف فيزيائية

وحدات القياس الفيزيائية

طرائف الفيزياء

مواضيع اخرى

علم الفيزياء : الفيزياء الحديثة : فيزياء الحالة الصلبة : مواضيع عامة في الفيزياء الصلبة :

التعبئة في البوليبيبتيدات والبروتينات Packing in Polypeptides and Proteins

المؤلف:  أ.د. نعيمة عبد القادر أحمد / أ.د. محمد أمين سلمان

المصدر:  علم البلورات والاشعة السينية

الجزء والصفحة:  ص278–281

2023-10-02

972

تتكون البروتينات من العديد من الأحماض الأمينية التي تحتوي على سلاسل جانبية بعضها محب للماء hydrophilic وبعضها كاره للماء hydrophobic والمبدأ الأساسي أن الأحماض الأمينية الكارهة للماء تميل لأن تستقر في قلب البروتين بينما السلاسل الجانبية المحبة للماء تكون في الأطراف الخارجية شكل (9-10)

شكل (10-9)

أ - يوضح عملية التعبئة لجزيئات من البوليبيبتيدات وكيفية عزل الأجزاء المحبة للماء والكارهة للماء في أماكن مختلفة.

ب- يوضح التركيب البلوري ووجود جزيئين من الماء لكل جزيء من البوليبيبتيد.

 

وقابلية الانجذاب للماء للوحدات الكربونية والأمينية في العمود الفقري للبروتين تتعادل بواسطة روابط هيدروجينية كما هو الحال في الحلزون α (أشكال 11-9، 12-9، 13-9)

      شكل (11-9)                                  شكل (12-9)

شكل اللولب α يوضح أهمية الروابط          لقطات توضح الشكل الفراغي لللولب الهيدروجينية         α أخذت عمودية على المحور اللولبي

 

تأثير عملية التعبئة في البلورات على الشكل الهندسي للجزيئات له أهمية لأنه يجيب على السؤال: هل شكل الجزيء في البلورة هو نفسه (كشكل له طاقة منخفضة وليس بالضرورة الشكل ذا الطاقة الدنيا) الموجود في المحاليل أو الغازات فتأثير عملية التعبئة بصفة عامة له تأثير متواضع على الشكل الهندسي للجزيئات إلا أن طاقة التعبئة ربما ترجح أحد الأشكال على الآخر.

شكل (13-9)

ترتيب الأحماض الأمينية في جزء من البروتين

 

وعلى أي حال فإنه من المحتمل أن تكون الظروف التي تتم فيها إنماء البلورة هي التي تجعل الشكل الهندسي للجزيء هو نفسه الشكل الموجود في المحلول حتى لو أنه ليس بالضرورة الشكل الموجود بصورة منتشرة popular.

وقد تمت دراسة أمثلة كثيرة وعلى سبيل المثال فإن خماسي البيبتيد الحلقي cyclic pent peptide تتكون بلورته من أربعة جزيئات في الوحدة اللامتماثلة بالإضافة لعدد سبعة جزيئات من التولوين Toluene وجزيئين من الميثانول methanol، وقد وجد أن الشكل الهندسي الجزيئات البيبتيد الأربعة متساوية تماما ما عدا بعض الاختلافات البسيطة كما في الشكل (14-9) وهذا يبرهن على تغير الشكل الجزيئي داخل البلورة.

شكل (14-9)

أربع جزيئات من الببتيد في الوحدة اللامتماثلة للوحدة البنائية للبلورة

EN

تصفح الموقع بالشكل العمودي