أولا: التلوث النفطي تعتبر المواد البترولية من أخطر الملوثات البحرية، ويكون ناتج عن العوامل التالية: -
1ـ ما ينساب من المواد البترولية إلى مياه البحار والمحيطات نتيجة لحوادث الناقلات.
2ـ تسرب المواد البترولية اليومي من السفن ومعامل تكرير النفط القريبة من الشواطئ.
3ـ ما يتسرب إلى مياه البحر خلال عملية حفر الآبار البحرية.
4ـ التسرب النفطي بسبب الحروب.
ثانيا: التلوث من مياه الصرف الصحي تسرب مياه المجاري الصرف الصحي سواء المعالجة أو غير المعالجة إلى البحر يؤدي إلى ارتفاع نسبة المواد العضوية التي تحتويها البحار مما يؤدي إلى نمو الفطريات والطحالب الذي بدوره يؤدي إلى الإخلال بالنظام البيئي البحري.
ثالثا: التلوث الكيميائي. ينتج بسبب وصول المبيدات الحشرية والمخلفات الصناعية من المركبات الكيميائية، ومساحيق الغسيل المختلفة إلى مياه البحار.
رابعا: التلوث من المعادن الثقيلة وصول المعادن الثقيلة مثل الزئبق إلى مياه البحر من المصانع ومحطات تحلية المياه وتوليد الكهرباء يؤدي إلى حدوث تسمم غذائي وأمراض عضوية للكائنات البحرية ومن ثم الإنسان.
خامسا: التلوث من المواد المشعة رمي النفايات النووية النشطة في البحار تؤدي بالمستقبل إلى تسمم البيئة البحرية بسبب ارتفاع نسبة الإشعاع النووي في الماء.