FASTA

حزمة FASTA Package) FASTA ) والاسم مأخوذ من ( Fast for All ) تشبه حزمة برامج BLAST مكونة من عدة برامج منها FASTAN للبحث عن تشابه التواليات مقابل قواعد النيوكلوتيدات وبرنامج EASTAP للبحث عن تشابه التواليات مقابل قواعد بيانات البروتينات وتوجد مواقع مزودة للحزمة للبحث عن تغايرات النيوكلوتيد المفرد SNP وآخر خاص بمكنون البروتين والعمليات الخاصة بالخياطة البديلة وآخر خاص بالجينومات وكثيرة غيرها.

وتحدد الأهمية الإحصائية لنتائج FASTA بعدد من القيم منها قيمة E ودرجة الشكم وهي مشابهة لما في برنامج BLAST  ، وهناك قيمة أخرى تستخدم في هذا البرنامج وهي قيمة Z وهي قيمة معيارية توضح الأهمية الإحصائية لمدى اصطفاف توالي الاستعلام Query Sequence مع تواليات قواعد البيانات البعيدة عنها، والقيم المرتفعة لل Z تعني معنوية أعلى لتطابق التواليين، فاذا كانت درجة Z اكبر من 15 دل ذلك على ان هناك تطابق معنوي كبير مع علاقة تماثل جذري Homology ، اما القيم بالمدى 5 - 15 دل ذلك على احتمالية وجود تماثل جذري عالي والقيم اقل من 5 فتشير الى علاقات ضعيفة.

ونتائج البرنامج يمكن ان تكون على شكل تقرير مصور يعتمد الألوان في تفسير وتحديد النتائج كما موضح في الشكل الاتي : 

ويظهر البرنامج قيم E ، كما ان هناك دليل لوني لقيم E التي على ضوئها يحدد مدى التطابق وفرز التواليات او ترتيبها. والجزء الآخر من التقرير يكون نصي يظهر فيه تعريف بالتوالي وهويته وبعض القيم الإحصائية ، وتظهر اصطفافات توالي الاستعلام وتوالي قاعدة البيانات، ويظهر التطابق بنقطتين عمودية في حين التشابه يشار اليه بنقطة واحدة ، اما عدم التطابق فيترك فارغا .

اخر الاخبار

اخبار العتبة العباسية المقدسة

أهالي كربلاء يحيون اليوم السابع لذكرى شهادة الإمام الحسين (عليه السلام)

مشروع أمير القراء الوطني يشهد مشاركة أكثر من 100 طالبٍ في مرحلته الثالثة

قسم الشؤون الفكرية يصدر دليلًا يوثّق القصص الفائزة في مسابقة فتوى الدفاع المقدسة

قسم الشؤون الفكرية يعلن عن توفير عددٍ من المكتبات الإلكترونية المتخصّصة للمؤسّسات الدينية والمكتبات العامّة

المزيد

الآخبار الصحية

تحذير طبي من تأثير جانبي "غير متوقع" لحقن التخسيس

حمامات الثلج قد تكون خطيرة وأحيانا مميتة.. ما السبب؟

ماذا يحدث لضغط الدم عند شرب عصير الرمان؟

اختراق علمي.. دواء يؤخر ظهور السكري من النوع الأول لسنوات

المزيد

الآخبار التكنلوجية

السيارات الكهربائية أنظف بنسبة 73% من سيارات الوقود

سيارة لوسِد الكهربائية تدخل "غينيس" بأطول مدى في العالم

نظرية جديدة تنسف كل ما نعرفه عن تشكل أول قارة في الأرض

منذ 37 ألف عام.. دراسة تكشف "أقدم أمراض" أصابت البشر

المزيد

مواضيع ذات صلة

Microbial Metabolism: Focal Metabolites and Their Interconversion

Relationship of Biocide Concentration and Time on Antimicrobial Killing

Specific Actions of Selected Biocides

Flow cytometry

البروتوبلازم Protoplasm

غشاء الخلية The cell membrane

مملكة البدائيات (Monera)

كيس الصفار ( المح ) Yolk sac

اقسام البيئة البحرية

بيئة المياه البحرية

المياه الجارية

المياه الساكنة