توفي سنة 1257 عن خمس وسبعين سنة في المشهد المقدس ودفن في دار السيادة.

في فردوس التواريخ: العالم المؤيد والفاضل المسدد مولانا ملا محمد فقيه جليل وعالم بلا بديل قرأ على صاحب الرياض والشيخ جعفر النجفي وكان يؤم الناس في المسجد المقدس الرضوي ويشتغل بالتدريس وتربية الطلاب وكان حسن البيان والتقرير وفي نهاية الشفقة على هذا الحقير.

وله مصنفات كثيرة منها :

1- شرح على منظومة بحر العلوم.

2- ثلاث مجلدات في حل أحاديث مشكلة.

3- رسالة في حل الحديث 18 من الخصال.

4- رسالة شرق وبرق.

5- رسالة كل جعفري .

6- كتاب في أصول الفقه .

7- ترجمة طب الرضا ع وغير ذلك من الرسائل وأجوبة المسائل.

ومكتبته في المشهد الرضوي لا نظير لها فيها من كل علم وفن.