يحدد تسلسل الأحماض الأمينية البنية الأولية

 تعرف البنية الاولية (Primary structure) لعديد الببتيد بمعرفة عدد ما تحويه من ثمالات الأحماض الامينية وبنيتها وترتيبها ، وتعرف الأحماض الامينية التي تشارك زمرها الكربوكسيلية ألفا في تشليل الروابط الببتيدية باسم ((ثمالات الأمينو أسيل)) ”Aminoacyl residues“ ، وتسمى باستبدال النهايات آت - ate وين - ine في أسماء الأحماض الامينية الحرة بالنهاية - يل yl - مثل ألانيل (Alanyl) وأسبارتيل (Aspartyl) وتيروزيل (Tyrosyl) وتسمى الببتيدات كمشتقات للثمالة الامينو أسيلية الموجودة في نهايتها الكربوكسيلية ، فعلى سبيل المثال ، يعامل رباعي الببتيد المكون ، على التوالي ، من الليسين — اللوسين — التيروزين — الجلوتامين (Lys-Leu-Tyr-Gln) كمشتق — للجلوتامين ويدعى ليسيل - لوسيل - تيروزيل - الجلوتامين ؛ لاحظ أن وجود النهاية — ين — في اسم الجلوتامين تعني أن زمرته الكربوكسيلية ألفا ليست مشاركة في تشكيل أي رابط ببتيدي (حرة).