[لأمير المؤمنين (عليه السلام) مؤلفات عدة منها : ]

1- جمع القرآن وتأويله أو جمعه على ترتيب النزول.

2- كتاب املى فيه ستين نوعا من أنواع علوم القرآن وذكر لكل نوع مثالا يخصه وذكرنا في المقدمات سندنا إليه .

3-الجامعة

4- الجفر

5- صحيفة الفرائض

6- كتاب في زكاة النعم

7- كتاب في أبواب الفقه.

 8- كتاب آخر في الفقه

9- عهده للأشتر

10- وصيته لمحمد بن الحنفية

11- كتاب عجائب احكامه وقضاياه

وقد جمعها جماعة من العلماء وجمعناها نحن في كتاب وأدرجنا فيه كتاب عجائب احكامه رواية محمد بن علي بن إبراهيم بن هاشم القمي عن أبيه عن جده مطبوع.

 12-ما اثر عنه من الأدعية والمناجاة جمعه بعض العلماء وسماه الصحيفة العلوية (ط).

13-مسنده الذي جمعه النسائي اي ما اثر عنه من الأحاديث والروايات .

 في كشف الظنون ما صورته : مسند علي لأبي عبد الرحمن أحمد بن شعيب النسائي المتوفي سنة 303 (اه) وهو غير كتاب خصائص النسائي في فضل علي بن أبي طالب (عليه السلام) الذي ذكر في كشف الظنون أيضا ؛ والثلاثة الأخيرة انما يمكن عدها من مؤلفاته بنوع من التوسع.

 14- جنة الأسماء في كشف الظنون ما صورته ؛ جنة الأسماء للإمام علي بن أبي طالب شرحها الامام حجة الإسلام محمد بن محمد الغزالي المتوفي سنة 505 كذا وجدت في بعض الكتب (اه) ولم يظهر ما هي جنة الأسماء هذه التي شرحها الغزالي وما هي جهة نسبتها إلى أمير المؤمنين (عليه السلام) ولعله وقع تحريف في الكلام .