وهي بدورها تنقسم حسب توفر المكونات الحية وغير الحية وهناك نظامين مشهورين لها:
أ- نظام بيئي طبيعي [ متكامل] ويشار له أحياناً بالنظام البيئي المفتوح (Open System)، وهو الذي يحتوي على جميع المكونات الأساسية الأولية المذكورة سابقاً [الحية وغير الحـيـة ] مثـل الغابة والمستنقع والنهر والبحيرة.
ب- نظام بيئي غير متكامل : وهو الذي يعرف أيضاً بالنظام البيئي المغلق (Closed Eco-system) وهو الذي يفتقر إلى واحد أو أكثر من المكونات الأساسية مثل الأعماق السحيقة للبحر والكهوف المغلقة حيث تشترك في كونها لا تحتوي الكائنات المنتجة لعدم توفر مصدر الطاقة الشمسية.
النظم البيئية حسب مصدر الطاقة:
تقسم النظم البيئية من ناحية مصدر الطاقة المحركة للنظام البيئي إلى ثلاثة أقسام:
1- نظام بيئي طبيعي يدار بالطاقة الشمسية مثل المحيطات المفتوحة والغابات.
2- نظام بيئي بشري يدار بالطاقة الشمسية حيث يقوم الإنسان تبعاً لمصالحه المعيشية باستبدال النباتات الطبيعية ببعض المحاصيل الزراعية ويضيف إليها مواد جديدة كالأسمدة والمبيدات الحشرية ومن أمثلتها البساتين والحقول الزراعية، وهذا النوع ساهم في تلوث البيئة وأضر بعناصرها الحيوية وغير
الحيوية.
3- نظام بيئي صناعي : يدار بطاقة الوقود، حيث تعتمد طاقة هذا النظام على مصدر غير الشمس كالكهرباء والوقود وغيرها. ومن أمثلته المدن ومجتمعات المصانع الكبرى، وهذا هو الذي أدى إلى تلوث
البيئة بشكل مباشر.