يمكن تصنيف الهرمونات بعدة طرائق، فحسب ذوبانيتها توضع في مجموعتين كبيرتين:

1- مجموعة الهرمونات الأليفة للشحميات (الكارهة للماء)، وتشمل الهرمونات السيتروئيدية  والدرقية والريتينوئيدات والكالسيترايول.

2 - مجموعة الهرمونات الأليفة للماء.

أما وفق تركيبها الكيميائي وطلائعها فهي تُقسم إلى خمس مجموعات:

1 - مشتقات الكوليسترول وتشمل الهرمونات السيتروئيدية والكالسيترايول.

 2- مشتقات التيروزين: الهرمونات الدرقية والكاتيكولامينات.

 3 - الببتيدات: تتنوع في عدد الحموض الأمينية في سلسلة واحدة (TRH :3 حموض أمينية؛ :ACTH:  39 ؛ هرمون جارات الدرق  84 :(PTH)؛191 : GH ) أو سلسلتين (الأنسولين: 21 و30).

4- البروتينات السكرية : TSH و FSH و LH و CG، وتشترك في الوحيدة ألفا وتختلف في الوحيدة بيتا.

5- الريتينوئيدات.

أما التصنيف الأشمل فيأخذ تَوَضع مستقبلات الهرمونات وطبيعة الإشعار المستخدم في تواسط العمل الهرموني داخل الخلية، وبذلك يصنف الهرمونات في مجموعتين رئيستين تحوي الثانية مجموعات فرعية (الجدول 1) ويعرض الجدول 2 الخصائص العامة للمجموعتين الرئيستين.

الجدول (1) تصنيف الهرمونات وفق آلية عملها .

الجدول (2) الملامح العامة لصفوف الهرمونات .

وهرمونات المجموعة الرئيسة الأولى ( Group I ) أليفة للشحميات وهي باستثناء T3 و T4، مشتقة من الكولسترول. وترتبط هذه الهرمونات بعد الإفراز ببروتينات ناقلة ما يحل مشكلة الذوبان ويطيل العمر النصفي في البلازما. ويعبر الهرمون الحر بسهولة الغشاء البلازمي لكافة الخلايا، ويلتقي المستقبلات إما في العصارة الخلوية أو في النواة في الخلايا الهدفية. ويُفترض أن معقد لجين - مستقبل هو المرسال داخل الخلوي في هذه المجموعة.

أما المجموعة الرئيسة الثانية (Group II) فتتألف من هرمونات ذوابة في الماء ترتبط بمستقبلاتها على  سطح الغشاء البلازمي للخلية الهدفية . وتتواصل الهرمونات التي ترتبط بسطح الخلايا مع العمليات الاستقلابية داخل الخلوية من خلال جزيئات وسيطة تُدعى المراسيل الثانية second messenger (الهرمون بحد ذاته هو المرسال الأول)، وتتولد كنتيجة للتآثر بين اللجين (الهرمون) والمستقبل. وبنـــاء على المرسال الثاني يتم تصنيف هذه المجموعة من الهرمونات إلى مجموعات فرعية (الجدول 1)

 1 - يتواسط cAMP تأثيرات المجموعة II-A؛

 2 - يتواسط cGMP تأثيرات المجموعة II-B؛

3 - المجموعة II-C تستخدم أيونات الكالسيوم أو مستقلبات فسفاتيديل الإينوزيتول المعقدة (أو كليهما) كإشعار داخل خلوي؛

 4 تختص المجموعة الأخيرة (II-D) باستخدام شلال كيناز البروتين وفُسفاتاز البروتين، وقد تم التعرف على العديد من هذه الهرمونات ويمكن لهرمون معين أن يستخدم أكثر من شلال كيناز واحد.

 يُذكر هنا أن بضعة هرمونات تندرج في أكثر من فئة واحدة، وتتغير التصنيفات تباعاً مــــع ظهـــور معلومات جديدة.