النبات
مواضيع عامة في علم النبات
الجذور - السيقان - الأوراق
النباتات الوعائية واللاوعائية
البذور (مغطاة البذور - عاريات البذور)
الطحالب
النباتات الطبية
الحيوان
مواضيع عامة في علم الحيوان
علم التشريح
التنوع الإحيائي
البايلوجيا الخلوية
الأحياء المجهرية
البكتيريا
الفطريات
الطفيليات
الفايروسات
علم الأمراض
الاورام
الامراض الوراثية
الامراض المناعية
الامراض المدارية
اضطرابات الدورة الدموية
مواضيع عامة في علم الامراض
الحشرات
التقانة الإحيائية
مواضيع عامة في التقانة الإحيائية
التقنية الحيوية المكروبية
التقنية الحيوية والميكروبات
الفعاليات الحيوية
وراثة الاحياء المجهرية
تصنيف الاحياء المجهرية
الاحياء المجهرية في الطبيعة
أيض الاجهاد
التقنية الحيوية والبيئة
التقنية الحيوية والطب
التقنية الحيوية والزراعة
التقنية الحيوية والصناعة
التقنية الحيوية والطاقة
البحار والطحالب الصغيرة
عزل البروتين
هندسة الجينات
التقنية الحياتية النانوية
مفاهيم التقنية الحيوية النانوية
التراكيب النانوية والمجاهر المستخدمة في رؤيتها
تصنيع وتخليق المواد النانوية
تطبيقات التقنية النانوية والحيوية النانوية
الرقائق والمتحسسات الحيوية
المصفوفات المجهرية وحاسوب الدنا
اللقاحات
البيئة والتلوث
علم الأجنة
اعضاء التكاثر وتشكل الاعراس
الاخصاب
التشطر
العصيبة وتشكل الجسيدات
تشكل اللواحق الجنينية
تكون المعيدة وظهور الطبقات الجنينية
مقدمة لعلم الاجنة
الأحياء الجزيئي
مواضيع عامة في الاحياء الجزيئي
علم وظائف الأعضاء
الغدد
مواضيع عامة في الغدد
الغدد الصم و هرموناتها
الجسم تحت السريري
الغدة النخامية
الغدة الكظرية
الغدة التناسلية
الغدة الدرقية والجار الدرقية
الغدة البنكرياسية
الغدة الصنوبرية
مواضيع عامة في علم وظائف الاعضاء
الخلية الحيوانية
الجهاز العصبي
أعضاء الحس
الجهاز العضلي
السوائل الجسمية
الجهاز الدوري والليمف
الجهاز التنفسي
الجهاز الهضمي
الجهاز البولي
المضادات الحيوية
مواضيع عامة في المضادات الحيوية
مضادات البكتيريا
مضادات الفطريات
مضادات الطفيليات
مضادات الفايروسات
علم الخلية
الوراثة
الأحياء العامة
المناعة
التحليلات المرضية
الكيمياء الحيوية
مواضيع متنوعة أخرى
الانزيمات
Base Excision Repair
المؤلف:
R. W. Sobol, J. K. Horton, R. Kohn
المصدر:
Nature 379, 183–186
الجزء والصفحة:
10-12-2015
2875
Base Excision Repair
Base excision repair is the DNA repair system for abnormal bases in DNA, such as uracil, hydroxymethyluracil, and hypoxanthine, and for nonbulky base modifications, such as thymine glycol and hydrates, 8-hydroxyguanine, O4-methylthymine, and 3-methyladenine (Fig. 1). The abnormal bases and simple base lesions are removed from DNA by the combined actions of DNA glycosylases (1-3) and AP (apurinic/apyrimidinic) endonucleases. The basic reaction carried out by glycosylases is the cleavage of the glycosylic bond joining the base to deoxyribose. Some of the glycosylases cleave both the glycosylic bond and the phosphodiester bond 3′ to the resulting AP site in a more or less concerted reaction. Hence, DNA glycosylases have been classified either as “pure” glycosylases or as glycosylase/AP lyases. AP endonucleases are also classified as either 3′- or 5′-AP endonucleases. All 3′-AP endonucleases are lyases that cleave the phosphodiester bond by b-elimination. The 5′-AP endonucleases carry out true hydrolysis.
Figure 1. Repair of 3-methyl adenine by base excision repair. Methyladenine DNA glycosylase cleaves the glycosylic bond of the alkylated base; this releases the alkylated base and leaves an AP site. An AP lyase and an AP endonuclease cleave 3′ and 5′, respectively, of the AP site, releasing the abasic sugar. The resulting gap is filled in by Pol I in E. coli and by Pol b or Po ld and e in humans, to produce repair patches of 1 to 10 nucleotides.
The combined actions of glycosylase, AP lyase, and AP endonuclease/exonuclease creates a one- to two-nucleotide gap in the damaged strand. This gap is filled in by DNA polymerase I in Escherichia coli, and mostly by DNA polymerase b (4) and to a lesser degree by DNA polymerases d and in yeast and humans (5). The resulting nick is ligated by DNA Ligase in E. coli, and in eukaryotes by the ligase I– (6) or ligase III–XRCC1 complex (7). Depending on the polymerase/ligase combination involved in filling in and sealing the gap, a repair patch of 1 to 10 nucleotides may be produced.
References
1.T. Lindahl (1974) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 71, 3649–3653.
2.T. Lindahl (1976) Nature 259, 64–66.
3.J. Laval (1977) Nature 269, 828–832.
4.R. W. Sobol, J. K. Horton, R. Kohn, H. Gu, R. K. Singhal, R. Prasad, K. Rajewsky, and S. H. Wilson (1996) Nature 379, 183–186.
5. Z. Wang, X. Wu, and E. C. Friedberg (1993) Mol. Cell. Biol. 13, 1051–1058.
6.R. Prasad, R. K. Singhal, D. K. Srivastava, J. T. Molina, A. E. Tomkinson, and S. H. Wilson (1996) J. Biol. Chem. 271, 16000–16007.
7.K. W. Caldecott, C. K. McKeown, J. D. Tucker, S. Ljungquist, and L. H. Thompson (1994) Mol. Cell. Biol. 14, 68–76.
الاكثر قراءة في مواضيع عامة في الاحياء الجزيئي
اخر الاخبار
اخبار العتبة العباسية المقدسة

الآخبار الصحية
