للإمام (عليه السّلام) تراث رائع خاض في جملة منه مجموعة من البحوث الفلسفية والمسائل الكلامية التي مُنيت بالغموض والتعقيد فأوضحها وبيّن وجهة الإسلام فيها كما خاض في كثير من كلماته اُصول الأخلاق وقواعد الآداب وأسس الإصلاح الاجتماعي والفردي و من أهمّ المسائل الكلامية وأعمقها مسألة القدر فقد اُثير حولها الكلام منذ فجر التاريخ الإسلامي وقد تصدّى أئمة أهل البيت (عليهم السّلام) لبيانها ودفع الشبهات عنها وقد سأل الحسن بن الحسن البصري الإمام الحسين عنها فأجابه (عليه السّلام) برسالة هذا نصّها : اتّبع ما شرحت لك في القدر ممّا أفضى إلينا أهل البيت ؛ فإنّه مَن لم يؤمن بالقدر خيره وشرّه كفر ومَن حمل المعاصي على الله عزّ وجلّ فقد افترى على الله افتراءً عظيماً وإنّ الله لا يُطاع بإكراه ولا يُعصى بغلبة ولا يهمل العباد في الهلكة لكنه المالك لِما ملكهم والقادر لِما عليه أقدرهم فإن ائتمروا بالطاعة لم يكن الله صادراً عنها مبطئاً وإن ائتمروا بالمعصية فشاء أن يمنّ عليهم فيحول بينهم وبين ما ائتمروا به فعل فليس هو حملهم عليها قسراً ولا كلّفهم جبراً بل بتمكينه إيّاهم بعد إعذاره وإنذاره لهم واحتجاجه عليهم ؛ طوّقهم ومكّنهم وجعل لهم السبيل إلى أخذ ما إليه دعاهم وترك ما نهاهم عنه. جعلهم مستطيعين لأخذ ما أمرهم به من شيء غير آخذ به ولترك ما نهاهم عنه من شيء غير تاركيه والحمد لله الذي جعل عباده أقوياء لِما أمرهم به ينالون بتلك القوة وما نهاهم عنه وجعل العذر لمَن لم يجعل له السبيل حمداً متقبّلاً فأنا على ذلك أذهب وبه أقول أنا وأصحابي أيضاً عليه وله الحمد .

وقد عرض هذا الكلام الشريف إلى بحوث كلامية مهمة والتعرّض لها يستدعي الإطالة والخروج عن الموضوع.