الكلوريد يساهم في الحفاظ على التوازن الحمضي القاعدي داخل الجسم، مما يساعد على بقاء درجة الحموضة (pH) ضمن نطاق مناسب لعمل الخلايا والإنزيمات. من الأدوار المهمة الأخرى للكلوريد أنه يدخل في تكوين حمض الهيدروكلوريك الموجود في عصارة المعدة، وهو ضروري لهضم الطعام وقتل البكتيريا التي قد تدخل مع الأكل.
الكلوريد يشارك أيضًا بشكل غير مباشر في إرسال الإشارات العصبية وانقباض العضلات، وذلك من خلال تأثيره على توزيع الشحنات الكهربائية عبر أغشية الخلايا.