الطفرة النظيفة Clean Mutation

الطفرات التي حصل فيها تغير في موقع محدد والحصول على مثل هذه الطفرات لا يمكن أن يتم باستعمال المطفرات لأنها تؤدي إلى إحداث خلل في مناطق مختلفة من الكروموسوم أو الجين. إن الحصول على طفرات نظيفة ومحددة يسهل إمكانية إضافة شفرة ختم للجين، أو امكانية تكوين جزء من البروتين الذي ينتج من الجين كما أنها توفر إمكانيات أخرى تتعلق بتعدد مواقع البدء في الاستنساخ من الممهدات يمكن أن تساعد في إنتاج مثل هذه الطفرات.