تمتلك الرابطة الببتيدية خاصية الرابطة المزدوجة الجزئية

بالرغم من كتابة الببتيدات على شكل روابط مفردة بين الذرات الكربوكسيلية والنتروجينية الفا ، فإن لهذه الرابطة خاصية المزدوجة الجزئية (الشكل 7-5) : فالدوران غير مسموح حول الرابط بين ذرتي الكربون والنتروجين . ينجم عن ذلك ان كل الذرات الأربع المرسومة في (الشكل 7-5) تقع في المستوى نفسه ويكون لهذه القساوة الجزئية نتائج هامة على ترتيب بنية البروتين فوق مستواها الاولي. وفي مقابل ذلك ، نجد ان هناك حرية واسعة في الدوران حول الروابط الأخرى الموجودة في هيكل عديد الببتيد . ويلخص (الشكل 5-8) هذا المفهوم ، وتمت فيه إحاطة الروابط القابلة للدوران بحلقا بينما ظللت الذرات الواقعة في المستوى ذاته.