هناك بعض الأحماض الأمينية النادرة فضلاً عن الأحماض الأمينية البروتينية التي تستخرج من نواتج التحليل المائي لبعض البروتينات وتعد جميعها من مشتقات الأحماض الأمينية البروتينية مثل 4- هيدروكسي برولين Hydroxy proline -4المشتق من البرولين والموجود بكثرة في البروتينات الليفية كالكولاجين وبعض البروتينات النباتية وكذلك - هيدروكسي لايسين Hydroxy lysine -5المشتق أيضاً من الكولاجين و N- مثيل لايسين Methyl lysine-N  و 3- مثیل هستیدین Methyl histidine -3والتي تعد مشتقات مثيلية للأحماض الأمينية البروتينية التي يمكن استخراجها من البروتينات العضلية (الشكل 9-5).