أدت الدراسات المستفيضة في كثير من الكائنات الحية إلى قاعدتين رئيستين مهمتين:

1-  إن الجينات المرتبطة والموجودة على نفس الكروموسوم تترتب طولياً وتحتل مواقع معينة ثابتة من الممكن تقدير المسافات بينها معبراً عنها بنسب مئوية للعبور الذي يقع بينها.

2- تتحدد المجاميع الارتباطية في أي نوع من الكائنات بعدد أزواج الكروموسومات فيه وذلك بالطبع نتيجة لوجود الجينات في الكروموسومات.

وعلى هذا استفاد علماء الوراثة من نتائج الارتباط والعبور في رسم الخرائط الكروموسومية ؛حيث تحدد قيمة المسافة بين أي جينين على نفس الكروموسوم بمعرفة قيمة احتمال حدوث العبور بين هذين الجينين، فكلما زادت المسافة بين الجينين زادت فرصة حدوث العبور بينهما والعكس صحيح. وعلى هذا يمكن اعتبار نسبة العبور مقياساً ليبين المسافة بين الجينات فكل وحدة مسافية على الخريطة والتي تعرف باسم سنتيمورجان (Centimorgan) تعادل واحد في المائة للعبور.

شكل (1) يبين الوحدات القياسية بين الجينات على الكروموسومات حيث إن كل وحدة تمثل سنتيمورجان

والخرائط الكروموسومية الموضوعة لكروموسوم أو كروموســـــــومات أي كائن مجهود جماعي تعاوني لعدد كبير من الباحثين ومن أمثلة ذلك الخرائط الكروموسومية لكروموسومات الدروسوفيلا ميلانو جاستر والتي قاد ووجه عملها بردجز (Bridges) وتضاف بالتدريج إلى هذه الخرائط مواقع جديدة للجينات، كما تزداد دقة كلما تجمعت بيانات عبورية مأخوذة من تجارب أكثر إحكاماً.

هذا ويستفاد من رسم الخرائط الكروموسومية في تحديد مواقع الجينات على الكروموسومات، وتحديد عدد الجينات التي تتحكم في صفة ما، وتساعد كذلك المربين على تحديد مواقع الجينات في الكروموسومات التي يجب نقلها من سلالة إلى أخرى لتربية سلالات مرغوب في صفات معينة بها. وتستخدم الخرائط الكروموسومية لتشخيص بعض الأمراض الوراثية، فعند معرفة البيانات عن البديل المسبب للمرض، يستطيع الباحثون تحديد الجزء من الـ DNA الذي يحمل الجين المسبب للمرض.

شكل (2) الخريطة الوراثية للكروموسومات الأربعة لحشرة الدروسوفيلا ميلانوجاستر تبين المواقع النسبية لبعض الجينات

شكل (3) يبين مواقع لبعض الجينات الهامة في الدروسوفيلا في الطراز البري وفي الأنواع الطافرة