كل إنزيم يستطيع العمل في أس هيدروجيني معين يطلق عليه الأس الهيدروجيني الأمثل optimum pH للإنزيم ويقل نشاط الإنزيم تدريجيا فوق وتحت القيمة المثلى (الشكل 2) التغيرات في الأس الهيدروجيني لها تأثير على الإنزيم في طريقة مختلفة لأن التباين في الأس الهيدروجيني يؤثر على تأين المجاميع المختلفة في المواقع الرابطة binding sites والمواقع التحفيزية catalytic sites للإنزيم كما ها نفس التأثير على المادة الأساس مما يقلل ذلك من تكوين معقد المادة الأساس. الإنزيم والتحفيز catalysis تغيرات الأس الهيدروجيني تسبب تغيرات في هيئة البروتين - الإنزيم بواسطة اضطراب الأواصر المختلفة الذي تحجز التركيب البنائي الثلاثي مما يؤدي ذلك إلى فقد نشاط الإنزيم التغيرات في الأس الهيدروجيني ممكن أن يثبط نشاط الإنزيم بسبب تفكك الرابطة بين المجموعة الرابطة و apoenzyme بعض الإنزيمات مثل الببسين يمكن إن يعمل على أكثر من مادة أساس واحدة لذلك فأن الأس الهيدروجيني له يتغير من مادة أساس إلى أخرى، الببسين له أس هيدروجيني امثل هو 2,2 هضم الهيموكلوبين، لكن أفضل عمل له على ألبومين البيض في أس هيدروجيني هو 1,5 التباينات في تركيز المادة الأساس أو درجة الحرارة له تأثير على الأس الهيدروجيني.

الشكل (2) تأثيرات الأس الهيدروجيني على نشاط الإنزيم